Cygwinにはアンインストーラがない。
普通にゴミ箱へ捨てるだけ。
あっても問題ないが、念のため。
regeditを実行し、
HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/Cygnus Solutions
および
HKEY_CURRENT_USER/Software/Cygnus Solutions
を削除する
あっても問題ないが、気になるなら。環境変数で設定した部分をすべて消せばOK。