Cygwinにはアンインストーラがない。

cygwin の削除

普通にゴミ箱へ捨てるだけ。

レジストリの削除

あっても問題ないが、念のため。

regeditを実行し、

HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/Cygnus Solutions

および

HKEY_CURRENT_USER/Software/Cygnus Solutions

を削除する

環境変数の消去

あっても問題ないが、気になるなら。環境変数で設定した部分をすべて消せばOK。